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《四部医典》全书共157章,分总则、论述、秘诀、后论四部分。总则部分共6章,概括地介绍了人体生理、病理、诊断和治疗;论述部分共31章,详细介绍了人体生理解剖、疾病发生的原因、途径及规律,卫生保健,药物性能,诊断方法,治疗原则等;秘诀部分共92章,专门论述了各种疾病的病理、病因、诊断和治疗等,并记述了大量的药物方剂;后论部分共28章,主要功能叙述了诊断法,药物的分类、剂型、给药途径、功能,外治疗法等。